Vous ne pouvez pas déterminer de manière fiable le sexe des pygargues à tête blanche en fonction des caractéristiques physiques telles que la taille ou l'apparence, sauf si vous comparez deux individus côte à côte:les femmes ont tendance à être légèrement plus grandes que les hommes. En dehors de cela, les femelles adultes et les mâles à tête blanche ont une taille, une coloration, des marques et des vocalisations similaires.
Une façon de déterminer avec précision le sexe d'un pygargue à tête blanche est par le biais de tests génétiques ou de sexing moléculaire, qui implique d'analyser l'ADN de l'oiseau pour identifier des marqueurs génétiques spécifiques qui se différencient entre les hommes et les femmes.