Les aigles royaux sont des prédateurs de premier plan et n’ont généralement aucun prédateur. Cependant, les aiglons et les œufs peuvent être la proie d'autres oiseaux tels que les corbeaux, les hiboux, les faucons et les aigles. De plus, certains animaux tels que les ours, les loups et les couguars peuvent occasionnellement s'attaquer aux aiglons ou aux adultes blessés.