Les balbuzards sont apparentés aux faucons, aux aigles et aux cerfs-volants, collectivement appelés rapaces. Ils appartiennent à l'ordre taxonomique des Accipitriformes, qui comprend à la fois des rapaces diurnes comme le balbuzard pêcheur et des oiseaux de proie nocturnes comme les hiboux. Les balbuzards pêcheurs font partie de la famille des Pandionidae, qui ne contient qu'un seul genre, Pandion, et une seule espèce, Pandion haliaetus.