MT Bogong abrite une variété de faune, notamment:
- mammifères: Les rongeurs alpins, les wallabies, les kangourous, les échidnes, les chauves-souris et le wombat occasionnel.
- oiseaux: Des aigles à queue coincés, des faucons pèlerins, des corbeaux, des currawongs, des pies et divers pinsons et éponges.
- Reptiles: Diverses espèces de lézards, y compris les scinks, les dragons et les geckos, ainsi que les serpents tels que le cuivre alpin et le serpent tigre.
- amphibiens: Grenouilles alpines, grenouilles corroborees et salamandres alpines.
- invertébrés: Diverses espèces d'insectes, d'araignées et de vers, y compris l'emblématique papillon de bogong, qui migre vers la montagne en grand nombre pendant les mois d'été.