La température corporelle d’un hippocampe nain est la même que la température ambiante de l’eau, ce qui signifie qu’il n’a aucun contrôle indépendant sur sa température corporelle. Ils sont incapables de maintenir une température interne constante et comptent plutôt sur l’environnement qui les entoure pour réguler leur température corporelle. Ainsi, leur température corporelle varie en fonction de la température de leur habitat marin.