Oui, les cobayes sont connus pour manger leurs jeunes. Ce comportement connu sous le nom de cannibalisme et est également pratiqué par d'autres espèces d'animaux. À l'état sauvage, une mère cobaye peut recourir au cannibalisme comme un moyen de réguler la population, lorsque la nourriture est rare ou lorsque l'environnement est sévère, ou qu'il peut manger une progéniture malade ou blessée afin d'éviter d'attirer un danger pour le reste de la litière. Le cannibalisme chez les cobayes est entraîné par une combinaison d'instincts naturels, de conditions environnementales et de facteurs nutritionnels.