L'autruche serait dans la branche des "néoaves" dans un cladogramme. Les néoaves sont un clade comprenant ces espèces d'oiseaux existantes dont l'ancêtre commun est l'ancêtre commun le plus récent de tous les oiseaux vivants moins des paléognathes (tinamous, d'autruches, rheas, cassoirs, émeus et kiwis) et est le plus inclusif de deux lignées qui se ramichaient à la base du rayonnement des oiseaux.