Les sarcodines vivent dans divers habitats, notamment les environnements marins, les plans d'eau douce et les environnements terrestres humides comme les sols, les feuilles mortes et les mousses. Les Sarcodines marines, comme les amibes et les foraminifères, sont abondantes dans les océans et contribuent à la biodiversité marine. Les sarcodines d'eau douce, telles que les amibes et les amibes testiculaires, habitent les étangs, les lacs, les ruisseaux et autres systèmes d'eau intérieure. Les Sarcodines terrestres, comme les amibes nues et les moisissures visqueuses, vivent dans le sol humide, la litière forestière et le bois en décomposition, jouant un rôle crucial dans la décomposition de la matière organique et le recyclage des nutriments.