Perte et fragmentation de l'habitat: Comme pour de nombreuses espèces en voie de disparition, la principale menace pour le cerf philippin est la perte de son habitat naturel. Les forêts sont de plus en plus dégagées pour l'exploitation forestière, l'agriculture et d'autres projets de développement. Cela détruit la nourriture et l'abri du cerf, et le rend plus vulnérable à la chasse.
Chasse et braconnage: Le cerf philippin est chassé pour sa viande, sa peau et ses bois. La chasse au cerf est un passe-temps populaire aux Philippines, et l'application des réglementations de chasse est faible. Le braconnage est également un problème majeur, car les cerfs sont souvent tués à la vente sur les marchés locaux.
maladie: Le cerf philippin est également sensible à une variété de maladies, introduites et endémiques. L'une des menaces les plus graves est la maladie du pied et de la bouche, qui peut provoquer une maladie grave et même la mort chez les cerfs.
Concurrence avec d'autres espèces: Le cerf philippin fait également face à la concurrence pour la nourriture et les ressources d'autres espèces, notamment des espèces de cerfs introduites telles que le cerf Rusa et le cerf Sika. Ces espèces introduites peuvent surpasser le cerf philippin pour la nourriture et l'habitat, et peuvent également transmettre des maladies.
Le cerf philippin est une espèce en voie de disparition et sa population diminue rapidement. À moins que des mesures de conservation efficaces ne soient prises, elle devrait disparaître dans la nature.