Les cobayes sont originaires des Andes d'Amérique du Sud , spécifiquement dans les régions du Pérou, de l'Équateur et de la Colombie.
Ils ont été domestiqués par l'ancienne civilisation inca à la fois aliments et fins religieuses . Il est intéressant de noter qu'ils ne sont pas réellement des porcs, ni de Guinée! Le nom "cobaye" serait dérivé du fait qu'ils ont d'abord été amenés en Europe via Guinée (en Afrique de l'Ouest) par les marins néerlandais.