Oiseaux
Le Pantanal abrite une grande variété d'oiseaux, notamment :
* Ara jacinthe
* Ara écarlate
* Grande aigrette
* Cigogne Jabiru
* Spatule rosée
* Ara à ailes vertes
* Toco toucan
* Harle brésilien
* Canard peigne
Mammifères
De nombreux mammifères différents peuvent être trouvés dans le Pantanal, tels que :
* Tatou géant
* Loup à crinière
* Pécari du Chacoan
* Cerf de la Pampa
*Jaguar
*Ocelot
* Chat tigre du Nord
* Cerf des marais
*Capybara
Reptiles et amphibiens
Une variété de reptiles et d'amphibiens habitent également le Pantanal, notamment :
* Anaconda vert
* Caïman noir
* Caïman Yacare
* Caïman à lunettes
* Tortue géante du Brésil
*Tortue à pieds rouges
* Tortue serpentine commune
* Grenouille empoisonnée dorée
* Rainette aux yeux rouges
Poisson
Le Pantanal abrite plus de 260 espèces de poissons, dont :
* Piranha à ventre rouge
* Piranha noir
* Payara
* Arapaima
*Tambaqui
* Pacu
* Poisson-chat
* Characins
* Cichlidés