* maladie: Les pygargues à tête blanche sont sensibles à une variété de maladies, notamment la grippe aviaire, le virus du Nil occidental et l'empoisonnement au plomb.
* prédation: Les aiglets et les œufs peuvent être pratiques par d'autres oiseaux de proie, comme de grands hiboux à cornes et des aigles dorés. Les pygargues à tête blanche adultes ne sont généralement pas pratiques, bien qu'ils puissent être tués par de plus grands prédateurs, tels que des couguars et des ours.
* collisions: Les pygargues à tête blanche peuvent entrer en collision avec des lignes électriques, des éoliennes et d'autres structures.
* Activités humaines: Les pygargues à tête blanche peuvent être tués par les humains par la chasse, le piégeage et la destruction de l'habitat.