La présence de structures homologues dans différents organismes est l'une des principales preuves de l'évolution. Les structures homologues sont celles qui ont la même forme de base, malgré le service de différentes fonctions. Par exemple, les pattes avant de reptiles et les ailes des oiseaux sont des structures homologues. Bien qu'ils aient des fonctions différentes, ils ont une structure de base similaire, composée d'un humérus, d'un rayon, d'un ulna et d'une série d'os plus petits. Cette similitude de structure suggère que ces deux organismes partagent un ancêtre commun qui avait une structure antérieure similaire. Au fil du temps, les pattes antérieures de l'ancêtre reptile ont évolué pour remplir une fonction différente chez les oiseaux, entraînant le développement d'ailes. Ceci est un exemple de la façon dont les structures homologues peuvent fournir des preuves des relations évolutives entre différents organismes.