Les pélicans bruns, comme tous les vertébrés, ont un endosquelette. Un endosquelette est un cadre interne d'os qui fournit un soutien et une protection pour le corps et ses organes. En revanche, un exosquelette est une coquille externe ou une couverture qui fournit un support et une protection, comme on le voit dans des arthropodes comme les insectes et les crustacés.