Les lys africains sont consommés par une variété d'organismes, notamment des hippopotames, des lamantins, des buffles d'eau, des éléphants, du poisson et un certain nombre d'espèces d'amphibiens et de reptiles. Des insectes tels que les coléoptères et les charançons peuvent également consommer certaines parties de la plante. Les espèces de poisson notamment telles que le tilapia et le poisson pulmonaire africain paissent activement sur les lys d'eau et jouent un rôle important dans le contrôle de la population. Enfin, certaines espèces d'oiseaux telles que les canards peuvent consommer les graines et autres parties des plantes.