Il y a deux théories concernant l'origine du Chihuahua. Une théorie est qu'ils sont descendus d'un petit chien appelé The Teolichi, qui a été conservé par la civilisation toltec au Mexique. L'autre théorie est qu'ils ont été amenés au Mexique en provenance de Chine par des explorateurs espagnols.
Cependant, selon l'American Kennel Club, le Chihuahua est originaire du Mexique et n'est lié à aucune autre race de chien.