Les protistes qui apparaissent les plus étroitement liés aux animaux sont les choanofagellates .
Voici pourquoi:
* similitudes morphologiques: Les choanoflagellates partagent des similitudes frappantes avec les cellules de col (choanocytes) trouvées dans les éponges, les animaux les plus simples. Les deux ont un seul flagelle entouré d'un collier de microvilli, qui sont utilisés pour filtrer les aliments de l'eau.
* preuve génétique: L'analyse moléculaire, en particulier des gènes d'ARN ribosomal, soutient fortement la relation évolutive étroite entre les choanoflagellates et les animaux. Ils partagent un ensemble unique de gènes que l'on trouve dans d'autres protistes.
* ancêtre potentiel: Il est largement cru qu'un ancêtre semblable à un choanoflagellate a donné naissance aux animaux.
Alors que d'autres protistes, tels que les amibozoans, ont été suggérés pour être étroitement liés aux animaux dans le passé, les preuves pointent massivement le choanoflagellate en tant que parents vivants les plus proches.