Les bergers allemands, comme tous les autres chiens, se reproduisent sexuellement. Lorsqu'un berger allemand masculin s'accouple avec un berger allemand, le mâle dépose son sperme dans le tractus reproductif de la femelle. Le sperme se rend ensuite aux ovaires de la femelle, où il fertilise les œufs. Les œufs fécondés implantent ensuite dans l'utérus de la femelle, où ils se transforment en chiots. La période de gestation pour les bergers allemands est d'environ 63 jours, après quoi la femelle donnera naissance à une litière de chiots.