Les bébés cobayes, également appelés chiots, ne doivent pas être séparés de leur mère jusqu'à l'âge de trois semaines. À ce stade, ils sont assez vieux pour vivre avec un autre cochon d'Inde mâle ou femelle. Les cobayes masculins et femelles peuvent être maintenus ensemble quel que soit leur âge, mais deux hommes ne doivent pas être conservés dans la même cage à moins qu'ils aient été stérilisés. Sinon, ils se battront probablement.