Il n'est pas conseillé de séparer un bébé cochon d'Inde de sa mère avant qu'il n'ait au moins trois semaines. À 10 jours, les bébés dépendent encore entièrement de leur mère pour la nourriture, la chaleur et les soins. Les retirer de la mère à cet âge peut provoquer un stress important et entraîner des problèmes de développement, tels qu'une mauvaise socialisation et une mauvaise auto-alimentation. Si possible, attendez que le bébé cobaye ait au moins trois semaines avant de le séparer de sa mère. À cet âge, le bébé mangera des aliments solides et sera mieux à même de se débrouiller tout seul.