Il n'y a qu'une seule espèce d'hippopotame: Hippopotamus amphibius , communément appelé l'hippopotame ou simplement le hippo .
Cependant, il y a deux sous-espèces:
* Hippopotamus amphibius amphibius: Il s'agit de la sous-espèce nommée et se trouve dans la majeure partie de la gamme de l'Hippo en Afrique subsaharienne.
* Hippopotamus Amphibius Kiboko: Cette sous-espèce se trouve dans l'ouest de l'aire de répartition de l'espèce, principalement en Afrique de l'Ouest.
Il est important de noter que ces deux sous-espèces sont très similaires et que les différences entre elles sont subtiles. Certains soutiennent qu'ils ne sont pas du tout des sous-espèces distinctes, mais plutôt des populations au sein d'une seule espèce.
Il y a aussi un Hippopotame Pygmy (Choeropsis Libriensis) , qui est une espèce distincte entièrement et beaucoup plus petite que l'hippopotame commune. Ils se trouvent dans les forêts du Libéria et de la Sierra Leone.
Ainsi, bien qu'il existe différentes populations et sous-espèces d'hippopotames, il n'y a qu'une seule vraie espèce d'Hippopotamus: Hippopotamus amphibius.