Le sanctuaire marin national de Monterey Bay comprend une superficie d'environ 6 094 kilomètres carrés (2 353 milles carrés). Il s'étend de l'embouchure de la rivière Pajaro dans le comté de Santa Cruz au côté sud de Point Lobos dans le comté de Monterey, formant un tronçon en forme de fer à cheval le long de la côte centrale de la Californie. Le sanctuaire comprend une gamme diversifiée d'habitats marins, des rives rocheuses et des forêts de varech aux plages de sable, des eaux profondes au large et des canyons sous-marins.