Les exigences de l'habitat des alévins varient en fonction des espèces de poissons. En général, ils préfèrent les zones végétalisées peu profondes avec de l'eau propre et bien oxygénée. La végétation offre une couverture des prédateurs et l'oxygène les aide à se développer correctement. En plus de ces deux paramètres clés, le substrat du lit de cours d'eau est également important, car le gravier aide à créer des espaces interstitiels à travers lesquels l'eau oxygénée peut passer tout en fournissant une couverture et des lieux pour que les alévins se reposent. De plus, les alévins sont sensibles à la lumière, ils préfèrent donc les zones à l'ombre. La température de l'eau peut également être importante, car certaines espèces de poissons nécessitent des températures d'eau plus fraîches que d'autres. Dans l'ensemble, la qualité de l'habitat physique est l'un des plus grands déterminants de l'élevage de salmonidés juvéniles et de la survie hivernale, qui est en grande partie fonction de l'état de l'habitat du cours d'eau par rapport aux flux d'eau pour maintenir la structure de l'habitat, la quantité de sédiments (par exemple, de sable) intégrés intégrés dans les graviers, qui peuvent inhiber le mouvement de l'eau dans les graviers et un impact négatif sur l'œuf sur la survie des alévin.