Les lamantins urinent et défèquent sous l’eau. Leur urine est expulsée par une ouverture urogénitale, tandis que leurs selles sont expulsées par une ouverture anale. Les lamantins n’ont pas de vessie, ils doivent donc constamment produire de l’urine pour éviter de se déshydrater. Leurs excréments sont constitués de matières végétales, d’algues et d’invertébrés. Les lamantins défèquent généralement une fois par jour, mais ils peuvent déféquer plus fréquemment s'ils mangent beaucoup de nourriture.