Les singes capucins ont d'abord été décrits par Georges-Louis Leclerc, comte de buffon , dans 1766 .
Bien que la date exacte de leur découverte soit inconnue, la description de Buffon du "sapajou à capuchon" (Sapajou à capuche) dans son "Histoire Naturelle" est considéré comme la première reconnaissance formelle de l'espèce.
Le nom "Capuchin" vient des robes à capuche portées par Capuchin Frères , qui ressemble à la coloration foncée distinctive des singes autour de la tête.