La couleur des yeux d'un singe rhésus peut varier en fonction de l'individu et des conditions d'éclairage, mais ses yeux sont généralement brun foncé ou noir brunâtre. L'iris, la partie colorée de l'œil, peut paraître plus marron ou plus noir selon la quantité de lumière qui s'y reflète. Parfois, il y a aussi du jaune dessus.