L'odeur des chauves-souris peut varier en fonction de l'espèce, mais en général, ils ont une odeur musquée et terreuse. En effet, les chauves-souris sécrètent une variété de produits chimiques de leur peau, de leur fourrure et de leur salive qui servent à diverses fins, y compris la communication, le territoire de marquage et l'attraction de compagnons. L'odeur des chauves-souris peut être particulièrement forte dans les grottes ou d'autres espaces fermés où ils se perchent en grand nombre. Certaines personnes trouvent l'odeur des chauves-souris désagréable, tandis que d'autres trouvent qu'elle est étrangement agréable ou même réconfortante.