Chez les humains :
* Peau : La peau abrite une variété de micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des virus. Ces microbes aident à protéger la peau contre les infections et les dommages, et jouent également un rôle dans la régulation de la température et du niveau d’humidité de la peau.
* Voies respiratoires : Les voies respiratoires sont tapissées de mucus qui piège les micro-organismes et les empêche de pénétrer dans les poumons. Cependant, certains micro-organismes peuvent encore traverser le mucus et provoquer des infections, telles que la pneumonie et la bronchite.
* Tube digestif : Le tube digestif abrite un grand nombre de micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des protozoaires. Ces microbes aident à digérer les aliments, à absorber les nutriments et à produire des vitamines. Ils jouent également un rôle dans la protection du tube digestif contre les infections.
* Tract urogénital : Le tractus urogénital abrite une variété de micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des virus. Ces microbes peuvent provoquer des infections, telles que des infections des voies urinaires et des maladies sexuellement transmissibles.
* Sang : Le sang est normalement stérile, mais il peut être infecté par des micro-organismes en cas de lésion cutanée ou en cas d'intervention médicale.
Chez les bovins :
* Rumen : Le rumen est un grand organe en forme de sac situé dans l'estomac de la vache. Il abrite une importante population de micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des protozoaires. Ces microbes aident à décomposer le matériel végétal et à le convertir en nutriments que la vache peut absorber.
* Réticulum : Le réticulum est un petit organe en forme de nid d'abeille situé à côté du rumen. Il contient également une importante population de micro-organismes qui contribuent à la dégradation du matériel végétal.
* Omasum : L'omasum est un troisième compartiment gastrique chargé d'absorber l'eau et les nutriments du digesta. Il contient également une population de micro-organismes, mais pas autant que le rumen et le réticulum.
* Caillette : La caillette est le véritable estomac de la vache. Il sécrète des enzymes digestives qui décomposent les protéines et les graisses. Il ne contient pas beaucoup de micro-organismes.
* Intestins : Les intestins sont responsables de l’absorption des nutriments contenus dans le système digestif. Ils contiennent également une population de micro-organismes qui aident à décomposer les nutriments et à produire des vitamines.
* Excréments : Les selles sont les déchets de la digestion. Ils contiennent un grand nombre de micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des protozoaires.