Il existe plusieurs espèces animales endémiques à la région de la vallée de Cagayan aux Philippines. Voici quelques exemples notables :
Aigle philippin (Pithecophaga jefferyi) : Ce majestueux oiseau de proie est considéré comme l'oiseau national des Philippines et se trouve dans les forêts tropicales de la vallée de Cagayan.
Moucherolle bleu de Cagayan (Cyornis sanfordi) : Cet oiseau frappant se trouve dans les forêts de Cagayan et des provinces voisines.
Rat nuageux du nord de Luçon (Crateromys schadenbergi) : Ce rongeur unique se caractérise par sa fourrure douce et dense et ses grands yeux.
Pigeon à cœur saignant de Luzon (Gallicolumba luzonica) : Un pigeon distinctif connu pour ses plumes de poitrine rouges en forme de « cœur saignant ».
Calao tarictique de Luzon (Penelopides manillae) : Une grande espèce de calao colorée trouvée dans les forêts tropicales.
En plus de ces espèces, les espèces endémiques de la région de la vallée de Cagayan comprennent également divers reptiles, amphibiens, insectes et espèces marines et d'autres espèces pourraient être révélées à mesure que l'exploration scientifique se poursuit.